Université Paris-Sud Faculté de Pharmacie CNRS INSERM

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novembre 2022 | janvier 2023


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Prestations

Dans le cadre de l’étude du protéome, la plateforme de protéomique utilise une approche dite Bottom-Up. Cette dernière implique de digérer dans un premier temps les protéines, puis d’injecter le mélange peptidique obtenu en LCMS.
Les peptides sont alors élués, détectés en fonction de leur rapport masse/charge et fragmentés de manière contrôlée. Les informations obtenues sur la masse exacte des peptides et la séquence en acides aminés permettent alors de remonter à l’identification des protéines et à leur quantification relative.
Selon leur nature, les modifications post-traductionnelles (MPT) peuvent être étudiées, tout dépend de leur stabilité dans les conditions d’analyse en place sur la plateforme.
Le système permet également l’analyse de protéines intactes purifiées sous certaines conditions.

process de l'analyse protéomique

A la suite d’un entretien entre les membres de la plateforme et le(s) porteur(s) de projet permettant de valider la faisabilité des expériences, les analyses sont réalisées selon la fiche de demande de collaboration en protéomique, remplie d’un commun accord.
Les conditions d’accueil sur la plateforme sont décrites dans la Charte de la plateforme Trans-Prot.

Charte TRANS-PROT
Fiche Projet Protéomique